ggplot2绘制的图形如果需要修改细节的话,没有对ggplot2有一定的了解的话是十分困难的,毕竟连创建这个包的作者Hadley Wickham都自称自己使用ggplot2的时候都需要查文档。在对ggplot2有一定了解的基础上如果需要修改ggplot图的话稍微查查文档基本能解决。
简介 本文内容基本是来源于 STHDA,这是一份十分详细的ggplot2使用指南,因此我将其翻译成中文,一是有助于我自己学习理解,另外其他R语言爱好者或者可视化爱好者可以用来学习。翻译过程肯定不能十全十美,各位读者有建议或改进的话,十分欢迎发Email(tyan@zju.edu.cn)给我。
简介 ggplot2有一个十分重要的功能就是分面,而今天要讲得R包ggpubr中也有一个函数facet()专门用来进行分面操作。
本文主要利用ggpubr包来探索基因组数据,主要是可视化TCGA基因组数据的基因表达谱。
R语言基本绘图函数中可以利用par()以及layout()来进行图形排列,但是这两个函数对于ggplot图则不太适用,本文主要讲解如何对多ggplot图形多页面进行排列。主要讲解如何利用包gridExtra、cowplot以及ggpubr中的函数进行图形排列。
简介 本文将绘制静态与交互式热图,需要使用到以下R包和函数: heatmap():用于绘制简单热图的函数 heatmap.2():绘制增强热图的函数 d3heatmap:用于绘制交互式热图的R包 ComplexHeatmap:用于绘制、注释和排列复杂热图的R&bioconductor包(非常适用于基因组数据分析)
1 简介 散点图通常用来刻画两个连续型变量之间的关系。绘制散点图时数据集中的每一个观测值都由散点图中的一个点来表示。利用包ggplot2可以绘制十分漂亮的散点图。 利用ggplot2绘图前先确保我们所使用的数据集是data.frame形式。ggplot2绘图利用映射将数据赋予给坐标轴上进而添加几何对象形成图形。绘图前先加载包ggplot2 即library(ggplot2)。
为了进一步加强以及整合自己data science的能力,最近打算在 我的博客开辟一个新类r4ds,专门用来记录学习Hadley Wickham大神的新作 R for Data Science的读书笔记。该书推荐我们入门data science可以从可视化开始,这也是该书目录布局的第一章。因此开始学习R语言可视化。