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awk命令

awk是一种编程语言，用于在unix下处理数据以及文本。数据可以来自stdin、一个或者多个文件或者其它命令的输出，同时支持自定义函数和正则表达式，更多是作为脚本来使用。

sort

sort命令在linux中非常有用，它可以对文件进行排序并将排序结果标准输出。sort即可以从特定的文件中也可以从STDIN中获取输入。 sort语法规则如下：

sort (选项) (参数) 文件

grep

grep全称是global search regular expression(RE) and print out the line，中文名即全面搜索正则表达式并把行打印出来。是一种强大的文本搜索工具，可以使用正则表达式搜索文本，并将匹配的行列打印出来。Unix的grep家族包括grep,egrep,fgrep以及zgrep等，egrep,fgrep与grep的差别很小，egrep支持更多的re元字符， fgrep就是fixed grep或fast grep，它们把所有的字母都看作单词，也就是说，正则表达式中的元字符表示其自身的字面意义，不再特殊grep可以通过-G、-E、-_F_命令行选项来使用egrep,fgrep的功能，zgrep可以用来处理ZIP格式文件。

“write code for humans, write data for computers”

鉴于以后要大量使用Linux系统处理生物信息学数据，因此加强自身linux系统的学习，开辟一个新的分类专门记录我学习Linux的学习笔记，一是为了我自己以后方便查看，二也是希望能帮助到其他学习Linux系统的人，共勉！！！

简介

集合可视化我们用得最多的是韦恩图，韦恩图在集合数少的时候是很好用的，但是当集合数多比如五个以上的时候那就会看花眼了，比如下面这副含有6个集合韦恩图，是发表在Nature上的文章里的，漂亮是漂亮，但是眼都快看花了。

简介

本文内容基本是来源于 STHDA，这是一份十分详细的ggplot2使用指南，因此我将其翻译成中文，一是有助于我自己学习理解，另外其他R语言爱好者或者可视化爱好者可以用来学习。翻译过程肯定不能十全十美，各位读者有建议或改进的话，十分欢迎发Email(tyan@zju.edu.cn)给我。

简介

tidyverse是一个数据科学的综合包，里面包含了数据分析一系列流程涉及的包，今天主要利用它绘制地图。这并不是它的强项，绘制地图leaflet才是利器，本文只是tidyverse的一个小练习。 目前该包支持有限的几个国家，比如美国，新西兰、意大利等，当然世界地图是支持的。

简介

ggplot2有一个十分重要的功能就是分面，而今天要讲得R包ggpubr中也有一个函数facet()专门用来进行分面操作。