Visualization

gganimate:数据跳动

简介 前面已经粗略学了一下gganimate的部分语法,下面继续。

gganimate:让数据动起来

简介 一年多以前我就写了篇R语言动画的博客: R语言可视化学习笔记之gganimate包。当时使用的是由 David Robinson开发的gganimate。后面由 Thomas Lin Pedersen接手,推倒重来,拓展了很多动画语法。具体的可参考 Thomas Lin Pedersen的 gganimate的Github主页。

Circos配置文件详解

Circos的配置文件准备 Circos的使用主要通过输入一个配置文件,改配置文件的主要内容以各种区块表示,大区块中可以包含小区快。区块中以"变量=值"的方式来进行参数的设定: <links> <link> file = data/set1.txt color = black ... </link> <link> file = data/set2.txt color = red ... </link> </links> 有些配置文件不需要改动,比如颜色、字体等,一般将这类信息保存到一个独立的配置文件中。只需要在主配置文件中声明包含这些独立的配置文件名及其路径,即表示使用这些配置信息。最常用的放置到主配置文件尾部的数行

三种方法在地图上绘制网络图

最近为了绘制几幅简单地图,查阅了一些资料,看到了Markus konrad的 帖子,非常赞。其中他的部分思路对于我们学习可视化很有帮助。

利用ComplexHeatmap绘制热图(一)

简介 Complexheatmap是由 顾祖光博士创建的绘制热图的R包,在他的 GitHub有十分详细的小品文(Vignettes)说明。Complexheatmap是基于绘图系统grid,因此如果有相应grid的知识,学习起来应该更顺手!

利用ggseqlogo绘制seqlogo图

简介 sequence logo图用来可视化一段序列某个位点的保守性,据根提供的序列组展示位点信息。这方面有很多在线小工具可以完成,这里使用R包 ggseqlogo进行可视化。

创建属于自己的调色板

简介 我们知道发表文章的时候不同杂志的配色方案是不同的,如果参加工作的话,不同公司的配色方案也是不一样的,每个人的色觉也是不一样的,所以如果可以创建属于自己的配色方案的话以后可视化就可以随心所欲了。

利用gganimate可视化R-Ladies发展情况

简介 这篇博客主要基于 d4tagirl,稍微有所修改。

利用R语言绘制世界航班路线图

简介 本文基于NASA的 夜间地图的基础上进行世界航班路线可视化,参考多篇博客以及可视化案例。

R语言可视化学习笔记之gganimate包

简介 gganimate包是ggplot2的扩展包,主要用于绘制动画。它在ggplot2的基础上了补充了一个美学映射frame,就像x,y,size,color,fill一样进行映射。