circlize

用circlize包绘制circos-plot

circlize包 circlize包在德国癌症中心的华人博士Zuguang Gu开发的,有兴趣的可以去看看他的 Github主页。这个包有两个文档,一个是介绍基本原理的绘制简单 圈圈图的,也是本次要介绍的。另外一份文档专门介绍基因组数据绘制圈圈图 Genomic Circos Plot,我自己还没看完,下次再介绍。 根据我的学习发现这个包与ggplot2很相似,也是先创建一个图层,然后不断的添加图形元素(point、line、bar等),这些简单的图形元素都有circos.这个前缀进行绘制,比如要绘制点,则用circos.points()。具体的下面一一介绍。