群体遗传进化
简介
群体结构又称为群体分层，指所研究的群体中存在基因频率不同的亚群。其基本原理是将群体分成k个服从哈迪温伯格平衡的亚群，将每个材料归到各个亚群并计算每个材料基因组变异源于第k个亚群的可能性，主要是利用Q矩阵进行衡量，一般来说Q值越大，表明每个材料来自于某个亚群的可能性越大。群体结构分析的软件有很多，比如：STRUCTURE、ADMIXTURE、FASTSTRUCTURE、TESS、BAPS等。这里不介绍如何使用这些软件进行群体结构分析，下次有时间再进行介绍。本文主要介绍利用R包pophelper对这些软件生成的数据进行展示。具体情况可以参考pophelper的
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