简介 TEsorter是基于保守蛋白结构域以及 REXdb数据库进行分类。TEsorter不仅仅可以对LTR-RTs进行分类，还可以对其它Class Ⅰ以及Class Ⅱ等类型的TE进行分类，只要 REXdb数据库覆盖了的TE都可以分类，具体如下：
简介 Consensus sequence又称为一致性序列、保守序列、共有序列等。维基百科的解释：
In molecular biology and bioinformatics, the consensus sequence (or canonical sequence) is the calculated order of most frequent residues, either nucleotide or amino acid, found at each position in a sequence alignment.
简介 转座子注释目前有非常多的软件，而EDTA(The Extensive de novo TE Annotator)整合了大部分目前常用的转座子注释软件，值得注意的是EDTA是全基因组从头注释。EDTA最大的好处就是简单实用，而且经过大量的改进，目前在安装、运行以及结果解释等方面十分完善。
简介 许多物种的基因组大部分是来自于转座子(Transposable elements, TEs)。此外，通过各种自我复制机制，TEs在大多数物种基因组中持续增殖。TEs会影响调控、转录以及新蛋白形成进而与性状比如疾病相关联。尽管TE表现出了显著的影响，但是很多基因组研究还是将它剔除在外，这主要是由于它具有高度的序列重复性，导致研究变得十分复杂。幸运的是随着大量的方法以及计算机软件的开发，TE的研究逐渐深入。本综述总结了TE研究的相关计算工具并着重指出了未来的TE研究存在的挑战与空白。对TE进行基因组上全面的分析不仅仅是“掩盖”这些重复序列(This Review presents a summary of computational resources for TEs and highlights some of the challenges and remaining gaps to perform comprehensive genomic analyses that do not simply “mask” repeats)。